Whole Genome Methylation Seq (WGMS)
Whole Genome Methylation Seq (WGMS)
La chiave per esplorare l’epigenoma con precisione.
Il Whole Genome Methylation Seq (WGMS) è la tecnologia più avanzata per lo studio della metilazione del DNA, offrendo una mappatura completa e ad altissima risoluzione. Grazie a questa tecnica, è possibile identificare con precisione le modifiche epigenetiche a singolo nucleotide, fornendo informazioni fondamentali sulla regolazione genica.
A differenza di metodi mirati, WGMS analizza l’intero genoma, permettendo di esplorare tutte le regioni regolatorie senza alcuna limitazione. Questa caratteristica lo rende uno strumento essenziale per lo studio di patologie complesse, come il cancro e le malattie neurodegenerative, dove le alterazioni epigenetiche giocano un ruolo chiave.
Uno dei grandi vantaggi del WGMS è la sua capacità di offrire un’analisi quantitativa affidabile, permettendo di confrontare con precisione diversi stati biologici, come tessuti sani e patologici. Inoltre, la sua versatilità lo rende applicabile a diversi tipi di campioni, dai tessuti biologici ai campioni di biopsia liquida.
Grazie alla sua accuratezza e alla possibilità di integrare i dati con altre tecnologie omiche, il WGMS è uno strumento indispensabile per la ricerca di biomarcatori epigenetici e per una comprensione più profonda della regolazione del genoma.
Perché scegliere il Negedia WGMS?
PROFILAZIONE COMPLETA DELLA METILAZIONE DEL DNA
Il nostro servizio permette di ottenere un profilo epigenetico dettagliato grazie al trattamento con bisolfito di sodio, che converte le citosine non metilate in uracile, lasciando intatte le citosine metilate.
SEQUENZIAMENTO PROFONDO E ANALISI ACCURATA
La nostra offerta comprende la preparazione della libreria con trattamento bisolfito, il sequenziamento PE (2×150 bp) con copertura fino a 30X e un’analisi bioinformatica completa, inclusi file FastQ, controllo qualità e report di metilazione.
Il nostro servizio include
Quantificazione di materiale di partenza
Preparazione della libreria
QC della libreria
Sequenziamento
(PE – 2×150 bp)
Analisi Bioinformatica
35 giorni lavorativi
Qualità del DNA
DIN > 7
Quantità di DNA
500 ng di DNA (10 µl / concentrazione > 50 ng/µl) per campione (quantificato con Qubit)
Campioni con bassa quantità o qualità
Contatta il nostro team per una consulenza personalizzata
Principali applicazioni del servizio
Mappatura della metilazione con risoluzione a singola base
Permette di ottenere un profilo epigenetico altamente dettagliato e integrato.
Studio della regolazione genica
Aiuta a comprendere i meccanismi di differenziazione cellulare, la diversità fenotipica e la regolazione genica.
Ricerca sulle malattie e biomarcatori epigenetici
Facilita l’identificazione di nuovi biomarcatori epigenetici e target terapeutici per tumori e malattie complesse.
La nostra Pipeline Bioinformatica
Grazie alla solida esperienza in NGS, offriamo un servizio di analisi WGMS ideale per la ricerca epigenetica su sviluppo, oncologia e biomarcatori.
01
Bisulfite Treatment & QC: Conversione chimica del DNA e verifica della qualità del campione.
02
Allineamento al Genoma: Mappatura delle sequenze trattate su reference genome.
03
Chiamata delle Metilazioni: Identificazione delle citosine metilate e non metilate.
04
Annotazione Funzionale: Assegnazione dei siti di metilazione a regioni genomiche chiave.
05
Integrazione Dati: Analisi combinata con RNA-seq per correlare metilazione ed espressione genica.
OUTPUT DEL SERVIZIO
01
File FastQ, BAM, BED e report dettagliato con dati quantitativi e visualizzazioni.
