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Grazie a questa attività Negedia produce, oltre ai servizi che offre, risultati di grande valore scientifico, pubblicati sulle più importanti riviste del settore.
Esrrb guides naive pluripotent cells through the formative transcriptional programme. Nat Cell Biol. 2023 May;25(5):643-657. doi: 10.1038/s41556-023-01131-x. PMID: 37106060; PMCID: PMC7614557.
Elena Carbognin, Valentina Carlini, Francesco Panariello, Martina Chieregato, Elena Guerzoni, Davide Benvegnù, Valentina Perrera, Cristina Malucelli, Marcella Cesana, Antonio Grimaldi, Margherita Mutarelli, Annamaria Carissimo, Eitan Tannenbaum, Hillel Kugler, Jamie A Hackett, Davide Cacchiarelli, Graziano Martello
Multi-omic approach characterises the neuroprotective role of retromer in regulating lysosomal health. Nat Commun. 2023 May 29;14(1):3086. doi: 10.1038/s41467-023-38719-8. PMID: 37248224; PMCID: PMC10227043.
Daly JL, Danson CM, Lewis PA, Zhao L, Riccardo S, Di Filippo L, Cacchiarelli D, Lee D, Cross SJ, Heesom KJ, Xiong WC, Ballabio A, Edgar JR, Cullen PJ.
Cellular population dynamics shape the route to human pluripotency. Nat Commun. 2023 May 17;14(1):2829. doi: 10.1038/s41467-023-37270-w. PMID: 37198156; PMCID: PMC10192362.
Panariello F, Gagliano O, Luni C, Grimaldi A, Angiolillo S, Qin W, Manfredi A, Annunziata P, Slovin S, Vaccaro L, Riccardo S, Bouche V, Dionisi M, Salvi M, Martewicz S, Hu M, Cui M, Stuart H, Laterza C, Baruzzo G, Schiebinger G, Di Camillo B, Cacchiarelli D, Elvassore N.
Integrated exome and transcriptome analysis prioritizes MAP4K4 de novo frameshift variants in autism spectrum disorder as a novel disease-gene association. Hum Genet. 2023 Mar;142(3):343-350. doi: 10.1007/s00439-022-02497-y. Epub 2022 Dec 5. PMID: 36469137; PMCID: PMC9950172.
Cesana M, Vaccaro L, Larsen MJ, Kibæk M, Micale L, Riccardo S, Annunziata P, Colantuono C, Di Filippo L, De Brasi D, Castori M, Fagerberg C, Acquaviva F, Cacchiarelli D.
Therapeutic homology-independent targeted integration in retina and liver. Nat Commun. 2022 Apr 12;13(1):1963. doi: 10.1038/s41467-022-29550-8. PMID: 35414130; PMCID: PMC9005519.
Tornabene P, Ferla R, Llado-Santaeularia M, Centrulo M, Dell'Anno M, Esposito F, Marrocco E, Pone E, Minopoli R, Iodice C, Nusco E, Rossi S, Lyubenova H, Manfredi A, Di Filippo L, Iuliano A, Torella A, Piluso G, Musacchia F, Surace EM, Cacchiarelli D, Nigro V, Auricchio A.
BrewerIX enables allelic expression analysis of imprinted and X-linked genes from bulk and single-cell transcriptomes. Commun Biol. 2022 Feb 17;5(1):146. doi: 10.1038/s42003-022-03087-4. PMID: 35177756; PMCID: PMC8854590.
Martini P, Sales G, Diamante L, Perrera V, Colantuono C, Riccardo S, Cacchiarelli D, Romualdi C, Martello G.
Transcriptome Analysis Reveals Altered Expression of Genes Involved in Hypoxia, Inflammation and Immune Regulation in Pdcd10-Depleted Mouse Endothelial Cells. Genes (Basel). 2022 May 27;13(6):961. doi: 10.3390/genes13060961. PMID: 35741725; PMCID: PMC9222422.
Fusco C, Nardella G, Di Filippo L, Dejana E, Cacchiarelli D, Petracca A, Micale L, Malinverno M, Castori M.
Improved SARS-CoV-2 sequencing surveillance allows the identification of new variants and signatures in infected patients. Genome Med. 2022 Aug 12;14(1):90. doi: 10.1186/s13073-022-01098-8. PMID: 35962405; PMCID: PMC9372932.
Grimaldi A, Panariello F, Annunziata P, Giuliano T, Daniele M, Pierri B, Colantuono C, Salvi M, Bouché V, Manfredi A, Cuomo MC, Di Concilio D, Tiberio C, Fiorenza M, Portella G, Cimmino I, Sorrentino A, Fusco G, Granata MR, Cerino P, Limone A, Atripaldi L, Ballabio A, Cacchiarelli D.
SARS-CoV-2 infection and replication in human gastric organoids. Nat Commun. 2021 Nov 16;12(1):6610. doi: 10.1038/s41467-021-26762-2. PMID: 34785679; PMCID: PMC8595698.
Giobbe GG, Bonfante F, Jones BC, Gagliano O, Luni C, Zambaiti E, Perin S, Laterza C, Busslinger G, Stuart H, Pagliari M, Bortolami A, Mazzetto E, Manfredi A, Colantuono C, Di Filippo L, Pellegata AF, Panzarin V, Thapar N, Li VSW, Eaton S, Cacchiarelli D, Clevers H, Elvassore N, De Coppi P.
The Microfluidic Environment Reveals a Hidden Role of Self-Organizing Extracellular Matrix in Hepatic Commitment and Organoid Formation of hiPSCs. Cell Rep. 2020 Dec 1;33(9):108453. doi: 10.1016/j.celrep.2020.108453. PMID: 33264615; PMCID: PMC8237389.
Michielin F, Giobbe GG, Luni C, Hu Q, Maroni I, Orford MR, Manfredi A, Di Filippo L, David AL, Cacchiarelli D, De Coppi P, Eaton S, Elvassore N.
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