Bioinformatica
BIOINFORMATICA
Negedia offre servizi avanzati di bioinformatica per trasformare i dati di sequenziamento in insight scientifici di valore.
Grazie a pipeline ottimizzate e soluzioni basate su cloud, supportiamo ricercatori, laboratori e cliniche nell’analisi e interpretazione dei dati genomici e trascrittomici.
Il nostro workflow bioinformatico
Supporto nel design sperimentale
Raw reads
quality check
Analisi avanzate di
II e III livello
Analisi custom su richiesta
Supporto post analisi
Storage dati a lungo termine
- Supporto nel design sperimentale: Pianificazione strategica per risultati scientifici affidabili e riproducibili.
- Controllo qualità: Valutazione approfondita delle sequenze grezze.
- Analisi avanzate di II e III livello: Esecuzione pipeline ad alte prestazioni.
- Report interattivi e visualizzazione dei dati: Accesso intuitivo e immediato ai risultati elaborati.
- Conservazione sicura dei dati in cloud: Archiviazione protetta e accesso continuo ai tuoi dati.
INCLUSO NEL COSTO DEL SERVIZIO:
- FastQ quality check
- Trasferimento via cloud (Google Cloud) sempre gratuito
- Download diretto tramite link firmato: il download è gratuito per la prima settimana
Soluzioni su Misura per la Tua Ricerca
Ogni progetto di ricerca è unico, e noi di Negedia lo sappiamo bene.
Per questo offriamo analisi bioinformatiche personalizzate per garantire risultati precisi e su misura per le tue esigenze.
- Analisi personalizzate per RNA e DNA: Dall’analisi di genomi alla clusterizzazione di geni espressi, trasformiamo i tuoi dati in insight concreti.
- Consulenza strategica per il design sperimentale: Ti supportiamo nella pianificazione delle tue analisi, affinché ogni passaggio sia ottimizzato per ottenere il massimo dai tuoi dati.
- Pipeline su misura, sempre scalabili: Costruiamo soluzioni bioinformatiche su cloud, conformi alla normativa europea GDPR e al sistema di gestione della qualità ISO 9001:2015, per garantire risultati affidabili, riproducibili e sempre accessibili.
Le nostre proposte
Bioinformatica applicata alla Genomica
L’analisi delle varianti genetiche è fondamentale per comprendere le basi molecolari delle malattie. Le nostre pipeline includono:
- Mappatura e filtraggio delle sequenze.
- Analisi delle varianti secondo le linee guida ACMG e AMP, con report dettagliati su piattaforme certificate CE-IVD.
- Identificazione di CNV, TMB e MSI
Analisi disponibili per i seguenti servizi:
Negedia Exome, Negedia Genome, Negedia DNAseq Low Input, Negedia Oncofocus, Negedia Oncoscreening, Negedia Oncoexplorer.
Bioinformatica applicata alla Metagenomica
Approccio all’avanguardia per lo studio del microbioma e delle comunità microbiche. I nostri servizi includono:
- Analisi del microbioma tramite sequenziamento Whole Genome Shotgun.
- Stima dell’abbondanza delle specie in un campione.
- Report dettagliato con raccomandazioni personalizzate per analisi di healthcare: clicca e scopri il report!
Analisi disponibili per i seguenti servizi:
Negedia Metagenome Whole Genome Shotgun
Bioinformatica applicata all'Epigenomica
I nostri servizi includono:
Analisi disponibili per i seguenti servizi:
DNA ATACseq, DNA CHIPseq, Nanopore WGS Methylation Peak Calling
Bioinformatica applicata alla Trascrittomica
L’analisi dell’espressione genica fornisce informazioni critiche sulla regolazione del genoma. Offriamo:
- Quantificazione dei trascritti.
- Identificazione di geni differenzialmente espressi.
- Chiamata di fusioni geniche.
- Clicca e scopri il report!
Analisi disponibili per i seguenti servizi:
Negedia Digital mRNAseq, Negedia Full Length mRNAseq, Negedia Total RNAseq, Negedia Small-RNAseq.
Bioinformatica applicata ai servizi di Single-Cell Genomics
Analisi avanzate per identificare variazioni trascrittomiche a livello di singola cellula. Ideale per studi di eterogeneità cellulare nei tumori e nelle malattie complesse.
- Elaborazione dati da piattaforma 10x Genomics Chromium.
- Normalizzazione e clustering delle espressioni geniche.
Analisi disponibili per i seguenti servizi:
Negedia Single-Cell Gene Expression, Negedia Single-Cell TCR
Bioinformatica applicata alla Spatial Transcriptomics
I risultati trascrizionali del servizio di Trascrittomica Spaziale vengono mappati con precisione rispetto alle immagini cellulari e tissutali, fornendo informazioni accurate sull’espressione genica nelle sezioni di tessuto.
A conclusione del servizio i risultati dell’analisi sono disponibili ed esplorabili su una piattaforma digitale in cloud creata direttamente dal nostro partner STOmics.
I plus del servizio?
- Gli esperimenti caricati sulla piattaforma possono essere condivisi
- Storage e download dati (grezzi e processati)
- Possibilità di fare analisi tracciabili e riproducibili
- Possibilità di utilizzare pipeline già preimpostate
- Supporto nella modalità sviluppo per una completa customizzazione delle analisi
Analisi disponibili per i seguenti servizi:
NEGEDIA Spatial Transcriptomics
Vuoi ricevere un preventivo o essere ricontattato per avere maggiori informazioni?
