NEGEDIA Single-cell
NEGEDIA Single-Cell RNA Sequencing:
Analisi dell’Espressione Genica a Singola Cellula
Il Single-Cell Sequencing rappresenta una rivoluzione nell’analisi genomica, permettendo di esplorare il profilo genetico ed epigenetico di ogni singola cellula in un campione eterogeneo. A differenza delle tecniche tradizionali, che forniscono dati mediati su popolazioni cellulari, questa tecnologia consente di identificare differenze uniche tra le cellule, rivelando sottopopolazioni, stati cellulari rari e meccanismi molecolari specifici.
Perché scegliere NEGEDIA Single-Cell?
ANALISI ULTRA DETTAGLIATA
Sequenziamo il materiale genetico di ogni singola cellula, offrendo dati ad alta risoluzione su espressione genica, variazioni genetiche ed epigenetiche.
APPROCCIO PERSONALIZZABILE
Supportiamo diversi tipi di analisi, tra cui trascrittomica (scRNA-seq), epigenomica (scATAC-seq) e multi-omica, per uno studio completo del profilo cellulare.
TECNOLOGIA ALL’AVANGUARDIA
Il nostro servizio si basa sulla piattaforma leader del settore 10x Genomics® Chromium™, garantendo alta efficienza nella cattura e nell’analisi di migliaia di cellule in un’unica corsa.. L’output stimato è di 200 milioni di letture per campione.
BIOINFORMATICA AVANZATA
Forniamo analisi dati complete, con visualizzazione dei cluster cellulari, identificazione di pathway biologici e report pronti per l’interpretazione.
Come funziona il nostro workflow?
Per garantire la massima accuratezza, il nostro protocollo include un rigoroso controllo qualità (QC) in ogni fase del processo, assicurando dati affidabili e riproducibili. Il workflow si articola nei seguenti passaggi:
Crio-recupero delle cellule e QC
Suddivisione delle cellule e barcoding
Preparazione della Library
Library QC
Sequenziamento
(PE – 1×28 – 1×91 bp)
Analisi dei dati
35 giorni
di lavorazione
Isolamento e Barcoding delle cellule
- Creazione di una sospensione monocellulare per separare le cellule.
- Etichettatura delle cellule con codici a barre per un’identificazione univoca.
Amplificazione del cDNA
- Pulizia del campione e amplificazione del cDNA per garantire una quantità sufficiente di materiale per la preparazione della libreria.
Preparazione della libreria e sequenziamento
- Costruzione delle librerie NGS per l’analisi dell’espressione genica.
- Sequenziamento su piattaforme di ultima generazione: Illumina MiSeq, Illumina NovaSeq 6000, MGI DNBSEQ-T7, MGI DNBSEQ-G400.
Analisi bioinformatica avanzata
- Mappatura dei dati grezzi al trascrittoma di riferimento.
- Analisi approfondita tramite pipeline specializzate per il confronto e l’interpretazione dei trascrittomi a livello singolo-cellulare.
Tipo di campione
Sospensione di cellule fresche o criopreservate
Quantità minima
almeno 20.000 cellule
Vitalità cellulare
>80%
Campioni con bassa qualità o quantità
Contatta il nostro team per una consulenza personalizzata
Principali applicazioni del servizio
Oncologia
Studio dell’eterogeneità tumorale e identificazione di nuove popolazioni di cellule maligne.
Immunologia
Analisi delle risposte immunitarie e caratterizzazione di linfociti T altamente diversificati.
Neuroscienze
Identificazione di sottotipi neuronali e studio delle connessioni cerebrali.
Sviluppo embrionale
Tracciamento delle dinamiche cellulari durante la differenziazione.
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